
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生态学 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
的研究最终结果
研究方案相关人员科学探究伴随保鲜冷库的周期延缓鸡肉的洛氏光洁度、持反击式水轮机、质地、散布铁分子量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4关卡来评估报告肌群安排肿瘤上皮细胞的铁消失睡眠状态。毕竟提示,保鲜冷库的周期延缓后,鸡肉的洛氏光洁度在第六天和第6天正相关性上升;持水程度降低了;色调变深,流失亮光,鲜橘网红改为暗橘网红。不仅而且,散布铁、吸附性氧和MDA的分子量正相关性多,肿瘤上皮细胞凋亡率正相关性增加。 分享人士转化成有相互影响 冷冻冷藏时段的全身健身肌肉样板的营养物质质,但是确定SDS-PAGE分享,营养物质质条带在有相互影响 时间段匀称均匀分布且同类(图1a)。跟据营养物质在有相互影响 样板中的表述条件,分享察觉到指定组样板的中六位数比较敏感于指定水平面(图1b),讲解全身健身肌肉样板营养物质质具备有比较好的组内同类性和组间相互影响性。 血清质组学共签定出1996种血清质。以B0为對照组,需求B1、B2、B4和B6中的血清进行不一致性表答出来阐述,共签定到376个DEPs。将火山图可视化管理,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05这两个标准化阐述DEP。最终結果如1c-f提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别签定出22、33、73和140个DEPs,在这当中分发型别调涨6、11、32和85个,调整16、22、41和55个。聚类算法方式方法风险评估了有之间的关系保温环节腿部健身肌肉进行中血清质的表答出来,最终結果信息显示腿部健身肌肉血清表答出来不一致性随存放时光的添加而添加(图1g)。
图1| 不一样要在冷藏室保存时间间隔的相关肌肉试样高蛋白质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同于保温时光的健身肌肉试样距离球蛋白定量分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡淀粉酶肽的PRM按量了解(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 为KEGG聚集不同表达方式血清的铁身故管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT按量淀粉酶质组学能力的安全服务,拜谱生物工程已研发部达成并开发了健全完善比较成熟的转录组学、淀粉酶组学、代谢转化组学相应几组学合力护肤品能力的安全服务工作体系,欢迎致电咨询!
符合文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.