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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
分解重c语言编程是肺部癌症突发和最新动态的标准,提子糖分解的变更起着关键功效。一种提升使肺部癌症生殖细胞系够迅速的拿养分并出现须要的分解里头体,因而可以支持怎强生长的。一直以来极具关键的意义,但肺部癌症生殖细胞系上浮糖酵解的措施仍不怎么了解一下。

近日,广州医科本科大学首个附屬醫院王学浩院土创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向药物能量是什么排泄检测分析服务。

英文字母版头:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

中文字幕主题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

朋友部门:南京医科大学

研究分析物料:细胞

拜谱提供数据服务管理:转录组测序+蛋白酶互作组+靶点养分分解代谢组

方法路径:

研究分析成果

01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的重要人类基因

本研究探讨采集程序HCC肺部癌症子样本(n=7)的单生殖血细胞膜RNA测序大资料集实施浅析,察觉到糖酵解生物大部分汇聚在肺部癌症生殖血细胞膜中,hdWGCNA浅析辨识出9个DNA功能(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的极限发展浅析设定YBX1为单独的极限发展风险控制影响因素(图1H)。进一部组合IHC、WB实验操作和肺部癌症阻止与靠近非肺部癌症阻止的环境空间转录组学大资料集否认YBX1是肝生殖血细胞膜癌治愈的意向靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被来确定为控制HCC细胞系糖酵解的关键所在主观因素

02、YBX1增进HCC中的有氧糖酵解和繁衍

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物卡路里分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1催进HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖

03、OGT与YBX1整合并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1配合并促进会YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化激发其磷硝化作用,最后增强其核转位

进两步加测YBX1的O-GlcNAc糖基化是否需要作用其磷碱化,在OGT敲低的HCC组织细胞系中或用OGT减弱剂OSMI-1正确进行处理,YBX1核核蛋白质关卡特殊拉低,YBX1磷碱化特殊减轻(图4A-C)。IP實驗表示,在同的Flag-YBX1底物关卡下,YBX1-WT的磷碱化关卡特殊过于YBX1-T57A,表面磷碱化的曾加不仅是根据更多的YBX1核核蛋白质表达方式方法(图4D)。剥离 了核和质多组分知道TMG正确进行处理的HCC组织细胞系中YBX1核表达方式方法的变高(图4E-F),进两步知道YBX1磷碱化的关键因素调分子是AKT(图4G-I)。这部分知道关注O-GlcNAc糖基化利用加速其磷碱化来提高YBX1核核蛋白质安全稳定量分析并加速核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有益于其进步骤造成磷酸性反应遮盖并可催进其核转位

05、YBX1驱动PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1使得PKM2转录

06、YBX1 也可以提高了组球蛋白乳碱化表达总体水平

科学研究发现YBX1敲低更为明显性大幅度较低营养素质乳过酸,尤为是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解促使作用剂2-DG的实验性查证了糖酵解与组营养素乳过酸的可以绑定,促使作用糖酵解可更为明显性大幅度较低H3K18la总体水平(图6D)。PKM2过表答不可逆转转YBX1敲低而致的H3K18la增涨,之外源乳酸处里并不是升级H3K18la,还不可避免YBX1表答上涨,显示现实存在正面跟进(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la顺利通过丰度于YBX1重启子可以提高其转录,该方式受O-GlcNAc糖基化调空(图6H-J),高并发现P300 上涨是YBX1加强H3K18乳酰化为用的规则(图6K-L)。

图6.YBX1增加H3K18乳过酸表达水平面

小文章个人总结

在这一项项实验中报道范文了YBX1在HCC中高描述,与此同时与糖酵解开切重要性。YBX1在T57处被O-GlcNAc把你想表达出来,因而稳定性血清质并增长其描述。这类把你想表达出来还提升YBX1在T57处的磷硝化作用,提升其核易位。对此,这一项环节提升了糖酵解重要性人类表观遗传的转录并多种多样乳酸的制造。于此,YBX1修改密码P300的转录,必将win7驱动组血清的乳硝化作用,很大是H3K18la,H3K18乳硝化作用正方向管控YBX1人类表观遗传转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观隐性基因双面馈环机能图

拜谱总结ppt

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶点热量新陈代谢组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、翻意后装饰组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

对比医学文献

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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