
2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱动物为其提供m6A甲基化具体分析科技贴心服务,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。
句子明称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)
顾客机关单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院
设计涂料:小鼠脑组织
拜谱能提供技能:m6A甲基化(MeRIP-seq)
引言图:
图1| 小结图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)
研发数据
1.DCI小鼠海马中m6Adna装饰的增加
钻研人工先打造了高脂飲食和社会认知困难(DCI)的小鼠建模方法。为十分对比组(n = 3)和DCI组(n = 3)互相的m6A人类dna淡化,钻研人工用MeRIP-seq进行了转录组比率内的m6A-seq数据分析。在DCI组的10664个简码人类dna转录物(mRNAs)中共中央感觉对比组的2376个不重合的m6A峰。相对来说一样,DCI组特征出23,75-7个非重合m6A峰。但其中,9345-7个甲基化人类dna在对比组和DCI组互相重合(图2)。
图2| 剖析组和DCl组m6a淡化表观遗传的维恩图
图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的该变
图4| 差别的甲基化m6A位点的径路生物富集
2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据分折的合力分折
其次探究人数将m6A MeRIP-Seq的数据展现报告和原本RNA-Seq的数据展现报告开始协力探讨,发现了163个mRNA,m6A峰和mRNA能力相关系数变动。41种mRNA的m6A和mRNA能力上浮,14种mRNA能力上涨。再者,30个什么是什么是染色体mRNA表达出来爱上浮,m6A能力上涨,7八个什么是什么是染色体mRNA表达出来爱上涨,m6A能力上浮(图5A)。最后的,搭配一个PPI网咯来展现163个什么是什么是染色体数字的蛋白质当中的无线连接(图5B)。
图5| m6A甲基化与mRNA形容的协同具体分析
图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG分折
拜谱生物制品个人心得体会
本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱微生物提供了m6A甲基化新技术安全服务,拜谱生物工程可提供完善成熟的淀粉酶组学、细胞代谢组学、转录组学或是两组学协同物料系统服务管理,欢迎致电咨询!
可以参考专著:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.